Друга информация
Съдържание:
1 Литературен обзор ....................................................................................... 4
1.1 Малки РНК ..................................................................................................4
1.1.1 Микро РНК ...............................................................................................4
1.1.2 Малки интерфериращи РНК ...................................................................5
1.1.3 Малки ядърцеви РНК ..............................................................................6
1.1.4 малки ядрени РНК ...................................................................................6
1.2 Секвениране от ново поколение ...............................................................6
1.2.1 Нови платформи за секвениране ............................................................6
1.2.2 Процесинг на данните .............................................................................8
1.2.3 Нормализация на данните ....................................................................10
2 Абиотичен стрес ...........................................................................................11
3. Цел и задачи ................................................................................................11
4. Материали и методи ...................................................................................12
4.1 Екстракция на РНК и създаване на библиотеки ......................................12
4.2 BGI ……………..................................................................................................12
4.3 TAIR ……........................................................................................................12
4.4 AgrisDB ………................................................................................................13
4.5 Perl …............................................................................................................14
4.6 Bowtie ……….. ...............................................................................................14
4.7 Xshell ………….................................................................................................15
4.8 Notepad++ …………........................................................................................15
5. Резултати и обсъждания ..............................................................................15
5.1 Предварителна подготовка .......................................................................15
5.2 Биоинформатичен анализ .........................................................................16
6. Извод .............................................................................................................49
7. Използвана литература ...............................................................................51